Влияние геномной рекомбинации на эволюцию SARS-CoV-2 и рост рекомбинантного варианта XFG в Германии

Предпосылки. Задержка роста в infancy остается серьезной проблемой общественного здравоохранения в странах с низким и средним уровнем дохода. Мы исследовали, влияли ли размер при рождении, микробиом кишечника младенца, биомаркеры роста и воспаления, а также макро- и микронутриенты грудного молока на результаты эффективности интегрированного пакета вмешательств в рост младенцев в 6 месяцев жизни. Методы. Этот медиаторный анализ был частью исследования «Интегрированные вмешательства для роста женщин и младенцев» (WINGS), факторного рандомизированного контролируемого испытания, проведенного в городских районах с низким и средним уровнем дохода в Дели, Индия. Пакет вмешательств включал питание, здоровье, воду, санитарные условия и гигиену (WASH), а также психосоциальную поддержку, предоставляемую в период предконцепции, беременности и раннего детства. В анализе участвовали 296 пар «мать-младенец» из группы, получившей вмешательства с предконцепции до конца беременности и раннего детства, и группы, получившей стандартное медицинское обслуживание. Используя контрфактическую причинно-следственную модель медиации, мы оценили медиирующие роли размера при рождении, биомаркеров младенцев в 3 месяца: инсулиноподобный фактор роста-1 [IGF-1], С-реактивный белок [CRP] и вид Bifidobacterium breve, а также биомаркеров грудного молока на третьем месяце (витамин B12 и общий белок). Результаты включали рост по возрастным z-оценкам (LAZ), вес по возрастным z-оценкам (WAZ), вес по длине z-оценкам (WLZ) в 6 месяцев, а также изменения этих антропометрических индексов между 3 и 6 месяцами. Множественные медиаторы оценивались одновременно с использованием параметрических регрессионных моделей, скорректированных по росту матери, индексу массы тела матери, наличию у семьи карты, подтверждающей нахождение ниже черты бедности, и месту рождения. Результаты. Пакет вмешательств значительно улучшил WAZ в 6 месяцев (общий эффект 0.31; 95% ДИ 0.04–0.58). Этот эффект был значительно медиирован через размер при рождении; снижение числа маловесных по гестационному возрасту (SGA) (средний причинно-следственный медиаторный эффект 0.15; 95% ДИ 0.04–0.28), что составляет примерно 44% от общего эффекта. Выводы. Улучшенный рост плода, отраженный снижением SGA, был основным биологическим путем, через который интегрированный пакет вмешательств оказывал влияние на рост младенцев в шесть месяцев.

Цель: Разработать и оценить базу данных о раке простаты, стандартизированную в соответствии с Обсервационным партнерством медицинских исходов (OMOP), из Электронной медицинской карты (ЭМК) Epic Университета Техаса в Медицинском центре (UTMB), и улучшить качество данных с помощью обработки естественного языка (NLP) и алгоритмов на основе антигена простаты (PSA). Материалы и методы: Мы построили конвейер данных для преобразования данных ЭМК UTMB Epic (2010-2021) в Общую модель данных OMOP (CDM) версии 5.4. Качество данных оценивалось путем сравнения стандартизированных данных OMOP с данными Регистра рака Гальвестона с использованием согласия по доступности, коэффициента Каунта и внутриклассовой корреляции. NLP использовалась для извлечения PSA, оценки Глисон и стадии рака из клинического текста, а алгоритмы на основе PSA использовались для выявления отсутствующего лечения и биохимического рецидива. Результаты: Мы извлекли 815 аналитических случаев из ЭМК UTMB. Из них 700 (85,9%) были полными и согласованы с регистром рака. PSA показал отличное согласие значений. Структурированные данные по оценке Глисон и стадии были разряженными (n<20), но NLP значительно улучшила их захват. Согласие по лечению было хорошим по сравнению с регистром рака и незначительно улучшилось для радикальной простатэктомии после применения алгоритма на основе PSA. Используя траектории PSA, мы выявили 60 случаев биохимического рецидива. Обсуждение: Стандартизированные данные OMOP из UTMB показали хорошее согласие с регистром рака. Однако структурированные поля ЭМК неполностью фиксировали данные о диагнозе, патологии и лечении. NLP и алгоритмы на основе PSA существенно улучшили захват данных. Ручной обзор также выявил ошибки в данных регистра, показывая, что стандартизированные данные ЭМК OMOP могут дополнить и помочь улучшить качество регистра рака. Заключение: Стандартизация OMOP в сочетании с NLP и алгоритмами на основе PSA улучшила качество данных о раке простаты и готовность к исследованию.

Фон. Ход пандемии зависит от свойств вируса, доступных мер общественного здравоохранения, их реализации и индивидуального поведения, все из которых взаимодействуют и изменяются во времени и пространстве. Понимание COVID-19 требует учёта этих факторов совместно. Методы. Национальная смертность, уровень смертности по штатам на 100 000 человек для четырёх представительных штатов, строгость мер по контролю, и охват вакцинацией были собраны из публичных источников за период с февраля 2020 года по сентябрь 2022 года. Свойства вируса, темпы мутации и эффективность вакцин были извлечены из опубликованных систематических обзоров и стандартизированы относительно значений диких типов. Результаты. Каждый штат испытал свою худшую волну, разделённую до 18 месяцев, с разницей в уровне смертности до 24 раз в течение основных волн. Строгость NPI изначально была высокой и реагировала на волны COVID-19, но в 2021 году снизилась как по величине, так и по реактивности, поскольку уровни вакцинации возросли, а затем стабилизировались. Вирусная эволюция сначала увеличила восприимчивость; с ростом популяционного иммунитета резко увеличилось явление иммунного уклонения, особенно с Омикроном, который вызвал аналогичные пики смертности во всех четырёх штатах и второй по величине национальный пик. Выводы. COVID-19 развивался не как единая национальная пандемия, а как регионально различающиеся эпидемии, которые фрагментировали общественное восприятие и ослабляли сплочённость. В то же время SARS-CoV-2 развил свойства, которые снизили явную и реальную эффективность вмешательств. Омикрон объединил эти процессы: несмотря на то, что он вызвал одну из крупнейших волн национальной смертности, он инициировал мало новых активизаций политики или увеличения числа бустерных прививок. Я описываю этот прогрессивный разрыв между эпидемической угрозой, эффективностью вмешательств, активацией политики и соблюдением со стороны общественности как приобретённый социальный иммунный дисфункция.

Мы исследовали, как подростки, живущие с ВИЧ в сельской местности провинции Квазулу-Натал в Южной Африке, управляют границами конфиденциальности в вопросах раскрытия информации. Мы провели групповые обсуждения с 31 подростком (в возрасте 16-19 лет), набранным из трех клиник по лечению ВИЧ. Анализ данных был проведен через призму теории управления конфиденциальностью. Были выявлены три основных темы: (1) владение и контроль над частной информацией, где подростки продемонстрировали различные уровни автономии над информацией о своем статусе ВИЧ, часто разрабатывая стратегии для скрытного управления приемом медикаментов; (2) управление раскрытием и границами конфиденциальности, в которой участники разработали нюансированные правила конфиденциальности, подверженные влиянию стигмы, контекста и динамики семьи; и (3) эмоциональная и социальная поддержка в управлении раскрытием, подчеркивающая значимую роль поддерживающих систем в процессе раскрытия. В целом, участники активно управляли границами конфиденциальности, тщательно контролируя информацию, избирательно раскрывая ее и стратегически координируя действия с членами семьи и медицинскими работниками. Наши результаты показывают, что подростки в сельской местности активно управляют границами конфиденциальности вокруг своего статуса ВИЧ с помощью хорошо развитых стратегий управления информацией. Существует сложное взаимодействие между личной инициативой, семейной динамикой и культурным контекстом в формировании решений о раскрытии. Эти идеи могут предоставить более эффективные поддержки для подростков, живущих с ВИЧ в условиях ограниченных ресурсов.

E3112 – это рекомбинантный человеческий фактор роста гепатоцитов (HGF), предназначенный для лечения острого печеночного недостаточности. Поскольку наличие антител к препарату (ADA) против E3112 может представлять значительный риск в клинических условиях, если они перекрёстно реагируют с естественным HGF организма, мы разработали анализы для E3112 и его ADA в человеческой сыворотке. Анализы E3112 и его ADA, разработанные с помощью лигандосвязующих анализов, были валидированы в соответствии с биоаналитическими рекомендациями и применены для клинических оценок фармакокинетики (PK) и иммуногенности. Эти анализы продемонстрировали способность обнаруживать E3112 при концентрации всего 0,156 нг/мл, в то время как чувствительность ADA была определена на уровне 42,3 нг/мл. Валидационные исследования, включающие контроль качества для PK анализа и положительный контроль ADA, подтвердили воспроизводимость анализов. Анализы ADA и PK были применены к анализам реальных образцов в поддержку клинического испытания E3112. После внутривенного введения E3112 уровни E3112 в сыворотке снизились с периодом полувыведения 19,3 часа. ADA не было обнаружено в преддозировочных или постдозировочных образцах. В совокупности эти данные указывают на то, что E3112 продемонстрировал благоприятный профиль PK с минимальной иммуногенностью в клиническом контексте.

Это исследование оценивало долгосрочное использование медицинских ресурсов (HCRU) и прямые медицинские затраты, связанные с COVID-19, среди взрослых и детей в Соединенных Штатах. Используя крупную национальную базу данных требований, мы количественно оценили дополнительную нагрузку на здравоохранение в течение года после первого диагноза COVID-19 по сравнению с сопоставимыми контрольными группами без диагноза COVID-19. Это ретроспективное когортное исследование использовало данные из базы данных IQVIA PharMetrics Plus. Пациенты с диагнозом COVID-19 (U07.1) между 1 июня и 30 ноября 2022 года были сопоставлены 1:1 с контрольными группами без COVID-19 по возрасту, полу, региону, типу страхования, Индексу коморбидности Чарлсона и базовому HCRU. Результаты включали HCRU и затраты на здравоохранение по всем причинам, понесенные в течение постостройного периода (≥31 день после первого диагноза COVID-19), измерялись кумулятивно через 1, 3, 6, 9 и 11 месяцев последующего наблюдения. Генерализованные линейные модели оценивали отношения затрат. В исследование вошло 944 627 пациентов с диагнозом COVID-19 (U07.1) и равное количество сопоставленных контрольных групп. По сравнению с сопоставляемыми контрольными группами средние общие затраты в течение 11 месяцев постостроенного наблюдения были на 27% выше среди взрослых ($11 508 против $9 040; <0.001) и на 42% выше среди педиатрических пациентов с COVID-19 ($3 997 против $2 812; <0.001). Затраты были выше для случаев COVID-19 на всех точках наблюдения. Среди взрослых на 11-м месяце наблюдения затраты увеличивались в зависимости от тяжести острого заболевания, средние затраты составили $10 372 для амбулаторных пациентов, $36 848 для госпитализированных и $51 643 для пациентов в отделении интенсивной терапии по сравнению с $8 617, $16 926 и $17 620 соответственно среди сопоставленных контрольных групп (все <0.001). Среди взрослых коэффициенты затрат достигли максимума на 1-м месяце наблюдения (1.32; 95% ДИ: 1.31-1.33) и снизились до 1.15 (95% ДИ: 1.14-1.15) на 11-м месяце. Было отмечено значительно более высокое постостроенное использование HCRU и затраты как среди взрослых, так и среди детей с диагнозом COVID-19 по сравнению с сопоставляемыми контрольными группами без диагноза, с увеличенными различиями в затратах, которые сохранялись до 12 месяцев после инфекции.