БиологияmedRxivOstrozovicova, M., Lackova, A., Grofik, M., Holly, P. et al.3 мин чтенияpreprint
Генетический ландшафт болезни Паркинсона в странах Вишеградской группы: исследование CEGEMOD
The Genetic Landscape of Parkinson Disease in V4 countries of Central Europe - the CEGEMOD study
Карточка статьи
Рубрика
Биология
Источник
medRxiv
DOI
10.64898/2026.06.30.26356950
Дата
02.07.2026
Автор
Ostrozovicova, M., Lackova, A., Grofik, M., Holly, P. et al.
Время чтения
3 мин
Это предварительная публикация, она не прошла научное рецензирование.
Аннотация
Аннотация Введение: Генетика болезни Паркинсона (БП) в основном изучалась на популяциях Западной Европы и Северной Америки, в то время как Центральная Европа была недостаточно представлена. Целью нашего исследования было охарактеризовать генетическую архитектуру БП в странах В4 (Словакия, Чехия, Венгрия и Польша). Методы: Исследование CEGEMOD объединило систематический обзор опубликованных генетических исследований БП из региона В4 с проспективным генетическим скринингом 1373 пациентов. Все участники прошли генотипирование, в то время как генетически неразрешенные пациенты с ранним началом или семейной формой БП прошли анализ полного экзома. Варианты интерпретировались с использованием современных клинических стандартов и валидировались с помощью секвенирования по Сэнгеру. Результаты: Систематический обзор выявил 48 подходящих исследований, сообщающих о патогенных или рискованных вариантах у пациентов с БП из стран В4. В проспективной когортной группе были идентифицированы патогенные, вероятно патогенные или установленные рискованные варианты у 157 из 1373 пациентов (11,4%). Варианты GBA1 составили большинство обнаруженных, в первую очередь определяемые двумя мягкими распространенными рискованными вариантами GBA1:p.(Thr408Met) и p.(Glu365Lys), после чего следуют LRRK2, PRKN, POLG, PLA2G6 и ATP1A3. Секвенирование полного экзома обеспечило дополнительную диагностическую доходность в 5% у генетически неразрешенных высокорисковых пациентов. Наши результаты также демонстрируют значительные различия в генетических исследованиях по Центральной Европе. Заключение: Данное исследование предоставляет крупнейшую генетическую характеристику БП в Центральной Европе на сегодняшний день. Исследование CEGEMOD расширяет знания о региональном генетическом ландшафте, поддерживает внедрение генетического тестирования в клиническую практику и создает важный ресурс для будущей прецизионной медицины и совместных исследований генетики БП.
Краткое резюме
Исследование CEGEMOD выявило значительные генетические аспекты болезни Паркинсона в странах В4, показав, что GBA1 является наиболее распространенным вариантом, а также продемонстрировало различия в исследованиях генетики в Центральной Европе.
Практический вывод
Результаты подчеркивают необходимость внедрения генетического тестирования в клиническую практику для раннего выявления и лечения болезни Паркинсона.
Ограничения
Это предварительная публикация, она не прошла научное рецензирование. Исследование ограничено лишь генетическими аспектами, не рассматривающими клинические характеристики и влияние других факторов на болезнь Паркинсона.
Пациенты с продвинутой хронической болезнью почек (ХБП) и дислипидемией подвергаются высокому риску почечной недостаточности и сердечно-сосудистых событий, однако многие из них не получают терапии, снижающей уровень липидов. Пентоксифиллин (ПТК) обладает противовоспалительными и антифибротическими свойствами, однако его связь с серьезными кардиоренальными исходами остается неопределенной. Мы провели ретроспективное когортное исследование среди взрослых пациентов с ХБП 3b-5 стадии и дислипидемией, зарегистрированных в программе предшествующей терминальной болезни почек с 2007 по 2018 годы. Пациенты, принимающие терапию, снижающую уровень липидов, были исключены. Инициаторы лечения ПТК были сопоставлены в соотношении 1:1 с не получавшими лечение, используя метод сопоставления по склонности. Основным исходом было прогрессирование к терминальной болезни почек (ТБП). Вторичными исходами были серьезные неблагоприятные сердечно-сосудистые события (СНСС), снижение расчетной скорости клубочковой фильтрации на 50% в течение 2 лет и удвоение уровня сывороточного креатинина. Чувствительные анализы включали временно изменяющееся воздействие, лаг и анализы на основе вех. Среди 3542 подходящих пациентов 2776 были включены в сопоставленную когорт. Использование ПТК было связано с более низкими рисками ТБП (коэффициент риска [КР], 0.85; 95% доверительный интервал [ДИ], 0.75-0.96) и СНСС (КР, 0.80; 95% ДИ, 0.65-0.98). Значительных ассоциаций для краткосрочного снижения функции почек или удвоения креатинина не наблюдалось. Анализы чувствительности с учетом времени смягчили оценки, приближая их к нулю, но не указывали на вред. У пациентов с продвинутой ХБП и нелеченой дислипидемией использование ПТК было связано с более низкими рисками почечной недостаточности в анализах, сопоставленных по склонности, тогда как ассоциация с сердечно-сосудистыми событиями была менее убедительной после чувствительных анализов. Эти результаты требуют осторожной интерпретации и дальнейшей валидации.
Исследование сосредотачивается на двигательных расстройствах и болезни Паркинсона, исследуя дисфункцию нейронных цепей и патофизиологию через призму современных технологий и междисциплинарного подхода. Акцент на нейровизуализации и генетике подчеркивает значимость персонализированного подхода к лечению.
Скрининг на антиген простаты (PSA) снижает смертность от рака простаты (PCa), но ограничен из-за переобследования и низкой специфичности для клинически значимой болезни. Эти ограничения подчеркивают необходимость более точных биомаркеров для различения агрессивных раков и инертных образований. Настоящий обзор исследовал продвинутые маркеры на основе крови, включая изоформы PSA, компоненты жидкой биопсии и индекс здоровья простаты; мочевые биомаркеры, такие как антиген рака простаты 3, фьюжн сериновой протеазы трансперембр качественного второго и панель MyProstateScore 2.0; и генетические маркеры, варьирующие от мутаций с высоким проникающим эффектом до полигеновых оценок риска. Дальше было рассмотрено интеграция этих биомаркеров с мультипараметрической МРТ, моделями калькуляторов риска и оценками для здравоохранения для оптимизации путей скрининга. Направления будущих исследований включают мультиомное профилирование, искусственный интеллект и новые технологии биосенсорики. Настоящий обзор направлен на то, чтобы предоставить всестороннюю и сбалансированную точку зрения на новые биомаркеры, которые изменяют персонализированный скрининг PCa.
Современные подходы машинного обучения (МО) в области открытия новых материалов сильно зависят от известных структурных баз данных, что ограничивает их способность выявлять совершенно новые типы структур. В данной работе мы разработали многоминимальный итеративный генетический алгоритм (MMIGA), который интегрирует межатомный потенциал, основанный на искусственной нейронной сети (ANN-ML), с итеративной схемой наказаний, вдохновленной метадинамикой. Мы демонстрируем надежность этого метода на сложной тернарной системе La-Co-Pb, характеризующейся несовместимостью Co-Pb и сложным энергетическим ландшафтом. Алгоритм MMIGA, улучшенный с помощью МО, успешно предсказывает основнойPbam структуру недавно синтезированной антагонистической пары фаз La4Co4Pb, новую структуру, упущенную в предыдущих предсказаниях, зависящих от баз данных МО, одновременно выявляя несколько метастабильных конкурирующих фаз. Кроме того, мы поставили задачу предсказать структуру антагонистической пары фаз La5CoPb2, нового соединения, найденного в ходе предыдущих попыток синтезировать предсказанную фазу La3CoPb. Имея всего лишь информацию о составе, наш подход MMIGA успешно предсказывает орторомбическую структуру La5CoPb2, точно совпадая со структурой, независимо определенной с помощью рентгеновской дифракции. Эффективно сопоставляя как глобальный минимум, так и соответствующие конкурирующие метастабильные состояния, этот подход предоставляет критически важные теоретические понимания выбора фаз для новых квантовых и магнитных материалов.
Цели: оценить взгляды генетических консультантов на внедрение амбиентного ИИ и его влияние на выгорание консультантов. Материалы и методы: мы использовали методику смешанных методов, проводя опрос о выгорании с использованием валидированного Индекса профессионального удовлетворения Стэнфорда (PFI) до и после внедрения амбиентного ИИ и исследуя взгляды на внедрение через полуструктурированные интервью. Результаты: 64% участников (16/25) заполнили предварительный опрос, из них одиннадцать завершили пост-опросы (69% уровень ответов на все три опроса). 14/25 участников прошли интервью. Использование амбиентного ИИ было связано с снижением выгорания через 90 дней; респонденты, которые сообщили о использовании амбиентного ИИ (по сравнению с неприменением), имели баллы выгорания на 1.05 пункта ниже в среднем (p=0.008). Преимущества внедрения включали эффективное использование с переводчиками, вспомогательные функции памяти, обобщение не структурированных частей заметок (например, история семьи/социальная история) и улучшенное взаимодействие с пациентами. Проблемы включали настройку шаблонов, переменную точность, упрощённый медицинский язык и нарушение доверительных отношений при получении согласия. Этические и регуляторные вопросы включали защиту данных, предвзятость, осведомлённость о ресурсах обучения и опасения по поводу замещения рабочих мест. Обсуждение: документация с использованием амбиентного ИИ может уменьшить бремя документации и уровень выгорания среди генетических консультантов. Оценивая как исходы, так и практические аспекты внедрения, наше исследование предоставляет доказательства для направленного масштабируемого интегрирования инструментов документирования на основе ИИ в клиническую геномную медицину. Заключение: амбиентный ИИ может поддерживать устойчивость рабочей силы в клинической генетике по мере масштабирования инициатив в области геномной медицины в системах здравоохранения. Важно решать конкретные потребности в документировании в генетике, при этом придавая приоритет доверию пациентов, прозрачности и контролю со стороны провайдеров для ответственного внедрения амбиентного ИИ.
Цель: Расстройство аутистического спектра (РАС) является генетически и фенотипически гетерогенным состоянием, что усложняет выявление причинных вариантов. Современные диагностические подходы имеют ограниченную эффективность, подчеркивая необходимость в новых стратегиях. Методы: Мы разработали фенотипический каркас для приоритизации генетических вариантов, ассоциированных с РАС, используя полные фенотипические данные и данные экзомного секвенирования (ЭС) от 125 детей с РАС. Мы использовали номенклатуру Общей фенотипической онтологии (HPO) для приоритизации кандидатных вариантов у каждого ребенка на основе сходства между наблюдаемыми фенотипами и ожидаемыми фенотипами, специфичными для вариантов. Результаты: Мы идентифицировали 228 терминов HPO, объединенных в 41 категорию фенотипов. Гены, ассоциированные с РАС, согласно базам данных HPO и SFARI Gene, были значительно обогащены этими фенотипами по сравнению с не-РАС генами (среднее 16.1+/-5.7 против 6.5+/-5.4; p=1.1e-231; HPO, и 16.0+/-6.7 против 7.3+/-6.0; p=2.1e-57; SFARI), что подтверждает актуальность этой батареи фенотипов для генетики РАС. У 36 генетически разрешенных участников подход, основанный на сходстве фенотипов, поставил 58% причинных вариантов на первое место и 89% в топ-3. В 89 неразрешенных случаях он выделил шесть новых клинически значимых вариантов, что увеличило диагностическую эффективность на 45%. Заключение: Наша новая батарея фенотипов РАС облегчает приоритизацию клинически значимых вариантов РАС и, следовательно, может повысить диагностическую эффективность, открытие генов и точную медицину на основе фенотипов для РАС.