Воздействие атмосферных твердых частиц и их химических компонентов на резерв яичников среди 29,610 женщин с бесплодием в провинции Шэньси, Китай.

Состав бактериального микробиома, связанного с семенами, может отражать эволюционные связи хозяев, что соответствует паттерну филосимбиоза. Хотя машинное обучение открывает новые возможности для предсказания составов микробных сообществ, существующие модели часто требуют предварительных микробных профилей или экологических переменных, что ограничивает их применение для необразцов хозяев. В данном исследовании мы проверили, могут ли последовательности внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) ядерных растений, использованные как маркер родства хозяев, предсказать бактериальные сообщества, связанные с семенами, на уровне видов, используя данные по 16S рРНК от 61 вида растений. Мы представили индивидуально адаптированные модели машинного обучения, которые используют расстояния Хэмминга на основе последовательностей для улавливания родства растений-хозяев. Среди протестированных моделей модель на основе расстояний Хэмминга и метода ближайших соседей (HD-KNN) достигла наивысшей предсказательной точности в целом, обеспечив среднюю дивергенцию Янгера-Шеннона (JSD) 0.276 между наблюдаемыми и предсказанными профилями микробиома. HD-KNN показала особенно хорошие результаты в плотно sampled группах хозяев, включая Brassicaceae и Poaceae, где были доступны близкородственные эталонные виды. В отличие от этого, модель на основе расстояний Хэмминга и регрессии гауссовского процесса (HD-GPR) продемонстрировала несколько лучшие результаты для филогенетически изолированных видов, что указывает на то, что эффективность модели зависит от представительства хозяев в обучающем наборе данных. Наша структура демонстрирует, что полученное из ITS ядерных растений родство хозяев несет частичный предсказательный сигнал для состава бактериального микробиома, связанного с семенами. Эти результаты создают основу для моделирования предсказаний бактериальных сообществ, связанных с семенами, с низким уровнем входных данных и могут помочь приоритизировать предсказания микробиома для необразованных видов растений, когда доступны близкородственные эталонные виды. Однако наши выводы строго ограничены бактериальными сообществами, связанными с семенами, и не должны быть напрямую обобщены на грибковые сообщества или другие растительные компартменты, такие как ризосфера или филосфера, которые могут формироваться под влиянием различных механизмов экологической фильтрации.

Данное исследование было направлено на оценку распространенности вируса папилломы человека (ВПЧ) и распределения генотипов среди вакцинированных женщин, а также на определение факторов, связанных с инфекцией ВПЧ после вакцинации. Были отобраны женщины, получившие вакцину против ВПЧ и прошедшие тест на цитологию на тонком слое (TCT) и тестирование генотипов ВПЧ до вакцинации. Каждая участница должна была заполнить онлайн-опросник, и был собран образец шейки матки для TCT и тестирования генотипов ВПЧ. Описана эпидемиология инфекции ВПЧ и генотипов. Факторы, связанные с инфекцией ВПЧ после вакцинации, были выявлены с помощью многовариантного анализа, представив скорректированные шансы (AOR) с 95% доверительным интервалом (95%CI). В исследовании участвовали 893 пригодные для исследования женщины. Распространенность ВПЧ после вакцинации составила 8,51%. Общими высокими рисковыми генотипами ВПЧ (hr-ВПЧ) были ВПЧ52, ВПЧ59, ВПЧ58, а общим низким рисковым ВПЧ (lr-ВПЧ) был ВПЧ53. Факторы, связанные с инфекцией ВПЧ после вакцинации, включали возраст ≥40 лет (AOR=2,92), статус в браке (AOR=1,56), получение первой дозы вакцины против ВПЧ после начала половой жизни (OR=2,57), наличие lr-ВПЧ до вакцинации (AOR=2,35) и наличие hr-ВПЧ до вакцинации (AOR=5,72). Распространенность ВПЧ после вакцинации была ниже, чем до вакцинации, и распространенные генотипы изменились на те, которые не охватывались введенной вакциной против ВПЧ. Возраст, семейное положение, время вакцинации против ВПЧ и предшествующая инфекция ВПЧ до вакцинации были выявлены как факторы, связанные с инфекцией ВПЧ после вакцинации. Рекомендовано получать вакцину против ВПЧ до начала половой жизни и проводить регулярное обследование на ВПЧ после вакцинации.

В 2025 году в провинции Гуандун, Китай, произошла беспрецедентная автохтонная вспышка чикунгуньи, связанная с кластером импортированных случаев. Мы проанализировали данные наблюдения на уровне городов с еженедельной разбивкой и обнаружили, что вспышка проявила четкий двухпиковый паттерн, с начальной вспышкой в городе Фошань, за которой последовала более крупная вспышка в соседнем городе Цзяньмэнь, которые вместе составили более 80% из 23 464 подтвержденных случаев, зарегистрированных в Гуандуне. Пространственно-временной анализ выявил пять значительных кластеров, включая две горячие точки в рамках одного города, соответствующие Фошаню (20 июля - 16 августа) и Цзяньмэня (14 сентября - 18 октября), что предполагает возможное пространственное смещение эпидемических горячих точек со временем. В дополнение мы проанализировали ежедневные данные наблюдения на уровне районов из Фошани и Цзяньмэня и адаптировали экспоненциальные модели к фазе снижения эпидемии. Оцененные скорости убывания составили -0.118 во Фошане и -0.142 в Цзяньмэне, что соответствует половинному времени эпидемии в 5.87 и 4.88 дня соответственно. В целом, наше исследование характеризует пространственно-временную динамику крупнейшей вспышки чикунгуньи, зарегистрированной в Китае на сегодняшний день, и подчеркивает важность усиления мониторинга вирусов, переносимых комарами, учитывая их растущий риск передачи и сложную динамику передачи.

Цель исследования заключалась в оценке реальной реализации генетического скрининга новорожденных (ГСН) в отношении уровня позитивности, частоты носительства и диагностической точности при наследственных метаболических расстройствах (НМР), а также в изучении осуществимости и проблем в региональном клиническом применении. В исследование было включено 1590 новорожденных (август 2023 — ноябрь 2024), родители которых выбрали ГСН. Применялась целевая панель секвенирования, охватывающая 465 генов, относящихся к 596 заболеваниям, вместе с традиционным биохимическим скринингом на 46 нарушений. Варианты были классифицированы согласно рекомендациям ACMG. Позитивные случаи были повторно вызваны для подтверждающего секвенирования методом Сангера и дополнительных биохимических тестов. Мы рассчитали уровень принятия, частоту носительства, идентифицировали горячие варианты и сравнили частоты аллелей с данными gnomAD_EAS. Диагностическую эффективность сравнили с биохимическим скринингом. Уровень принятия составил 10,41% (1590/15,272). Общая позитивность составила 7,74% (123/1590). Из них 10 оказались положительными на гены, связанные с НМР, 8 из которых были подтверждены, что дало положительное прогностическое значение (PPV) 80,00% для НМР, что значительно выше, чем 5,71% у биохимического скрининга. Мы обнаружили 2354 варианта с частотой носительства 70,94%. Горячие варианты НМР включали c.609G>A, c.658_660del и c.1286A>G, частоты малых аллелей которых отличались от gnomAD, что указывает на региональную специфику. Высокие показатели носительства также наблюдались у генов лизосомного хранения (c.1901T>C, 53,57%; c.2041G>A, 32,14%). ГСН показывает высокое PPV и специфичность, сокращая количество ложноположительных результатов и предоставляя ранние молекулярные данные о НМР. Отличия горячих и малых аллельных частот подчеркивают необходимость создания местной генетической базы данных. Несмотря на растущее принятие ГСН, такие факторы, как стоимость и различные уровни осведомленности среди медицинских работников, остаются барьерами для его более широкого внедрения. Это исследование предоставляет предварительные данные в поддержку реализации региональных программ генетического скрининга новорожденных и информирует стратегии вторичной и третичной профилактики.

EGFR L858R — это активирующая мутация, связанная с аномальным сигналингом EGFR, и молекулы, способные распознавать этот мутант, продолжают быть предметом исследований. В данном исследовании была проведена скрининговая оценка виртуальной библиотеки пептидов, содержащей 59 319 гептапептидов, с использованием кристаллической структуры EGFR L858R, что привело к выявлению четырех пептидов с благоприятными прогнозируемыми способностями к связыванию. Среди них Пептид-1 показал наибольшую аффинность связывания в исследованиях MST (= 0,35 ± 0,02 μM), что превышает аффинность референтного пептида DTP-1. Интегрированные структурные и динамические анализы продемонстрировали, что Пептид-1 может формировать относительно стабильную конформацию связывания с EGFR L858R. Пептид-1 снижал жизнеспособность клеток SKOV3, OVCAR3 и CaOV3, показывал более слабые эффекты на клетках IOSE-80, а его активность была значительно ослаблена после трансдукции shRNA, нацеленному на EGFR. Кроме того, Пептид-1 уменьшал экспрессию мРНК Cyclin D1 и увеличивал экспрессию мРНК Caspase-3. Эти результаты указывают на то, что Пептид-1 может быть дополнительно исследован как пептид, нацеленный на EGFR L858R.

В Китае в 2024 году произошёл резкий рост случаев коклюша. Мы поставили цель охарактеризовать эпидемиологические тенденции, клинические симптомы и молекулярную эволюцию, используя платформу наблюдения на основе цифровых технологий в четырёх крупных городах Китая. С мая 2024 года по август 2025 года у симптоматических пациентов в Пекине, Шанхае, Гуанчжоу и Шэньчжэне проводился скрининг с помощью цифровой платформы здравоохранения. Позитивность определялась с использованием RT-PCR, направленного на IS481. Геномный анализ, включая типирование MLVA и секвенирование генов вирулентности/резистентности, был проведён для подгруппы образцов с высокой вирусной нагрузкой. Всего 3356 (4,9%) участников дали положительный результат по скринингу IS481. Наблюдалась значительная пространственно-временная неоднородность позитивности, достигшая пика в середине 2024 года, за которой последовал переход в 2025 году. Шанхай (7,8%) демонстрировал значительно более высокий коэффициент позитивности по сравнению с Пекином (2,1%) и Гуанчжоу и Шэньчжэном (2,6%). Примечательно, что 52,4% (1759/3356) случаев произошли среди детей школьного возраста (6-17 лет), что ознаменовывает значительный сдвиг уязвимости от дошкольников к школьникам. Клинически коклюш проявлялся особым профилем, характеризующимся высокой распространённостью кашля (85,0%-90,2%) и низкой частотой лихорадки (6,6%-12,8%). Геномный надзор (n = 63) подтвердил абсолютное преобладание линейки, чувствительной к эритромицину (95,2%) среди подгруппы с высокой бактериальной нагрузкой. Тест на основе IS481 среди пользователей цифровой платформы с симптомами показывает критический сдвиг коклюша к школьному возрасту и преобладание в подгруппе с высокой нагрузкой. Эти результаты подчеркивают клиническую необходимость вакцинационных стратегий, нацеленных на развивающиеся уязвимые группы, и подчеркивают необходимость продолжать наблюдение за циркулирующими вариантами.