Переход позитивности на коклюш по гену IS481 от дошкольников к школьникам и преобладание в группе с высокой вирусной нагрузкой: исследование с использованием цифровой платформы наблюдения в Китае.

Возбудитель чумы представляет собой постоянную угрозу глобальному здравоохранению из-за быстрой передачи и высокой смертности. Чтобы обеспечить быструю и полевую слежку, мы разработали высокоразрешающую, независимую от культуры, методику генотипирования для точной идентификации линий и подлиний. Мы собрали и проверили 25 канонических однонуклеотидных полиморфизмов (canSNPs), чтобы определить 24 глобальных линии, а также 12 регионально специфичных canSNP, отличающих 9 преобладающих подлиний, циркулирующих в Внутренней Монголии, Китай. Объединив ARMS-HANDS ПЦР с анализом кривой плавления в нескольких цветах, мы создали иерархический мультиплексный тест, способный одновременно генотипировать 37 canSNP в трех реакциях реального времени ПЦР. Система продемонстрировала высокую чувствительность (предел обнаружения: 50 копий генома на реакцию) и достигла 100% точности в двойной слепой оценке 166 штаммов. Интегрированная в портативное устройство "образец-в-результат", методика позволила провести прямую идентификацию линии из образцов печени инфицированных песчанок в течение 120 мин, точно обнаружив эпидемиологически важную подлинюю 2.MED3.1.4 в образцах, собранных в полевых условиях. Эта надежная и развертываемая платформа генотипирования устраняет основные ограничения современных усилий по слежке за чумой, предлагая трансформирующее решение для расследования вспышек в реальном времени и эпидемиологического мониторинга в условиях ограниченных ресурсов.

Тубулоинтерстициальный фиброз (ТФ) играет важную роль в ухудшении диабетического заболевания почек (ДЗП). Эпителиально-мезенхимальный переход (ЭМП) в трубчатых эпителиальных клетках (ТЭК) приводит к ТФ в процессе прогрессирования ДЗП. Гипоксически индуцируемый фактор-1α (HIF-1α; HIF1A) был описан как способствующий ЭМП и ТФ через индуцирование пути трансформирующего фактора роста-β1 (TGF-β1). В этом исследовании мы поставили цель изучить медиирующее действие ключевых генов в индуцированном HIF-1α ЭМП и ТФ при ДЗП. Данные профилирования экспрессии генов в тубулоинтерстициальной области от пациентов с ДЗП и здоровых контролей (ЗК) были получены из базы данных GEO, а для биоинформатического анализа использовались пакеты R; валидация биоинформатических данных проводилась на мышах db/db и линии проксимальных ТЭК (HK-2). В результате мы сосредоточились на катепсине S (CTSS). Функциональное обогащение указало, что HIF1A и CTSS совместно участвуют в активации воспалительных процессов, депозиции внеклеточного матрикса и клеточных взаимодействиях. Эксперименты подтвердили, что в моделях ДЗП HIF-1α может повышать уровень катепсина S, способствуя частичному переходу ЭМП и фибротическому ремоделированию в ТЭК, тем самым ухудшая диабетическое повреждение почек. В заключение, CTSS может выступать в качестве эффектора, внедренного HIF-1α, принимающего участие в регуляции связанного с частичным ЭМП фенотипического изменения и фибротического ремоделирования ТЭК в моделях диабетического заболевания почек.

Пневмония, полученная в сообществе (ППС), является одной из самых распространенных причин смерти среди детей. Получение образцов из нижних дыхательных путей у детей с ППС до сих пор представляет собой сложную задачу. В этом многопрофильном исследовании приняли участие 198 детей с ППС, которым показана фибробронхоскопия. Были собраны назофарингеальные аспираты и жидкость бронхоальвеолярного лаважа (ЖБАЛ) для целевой секвенирования следующего поколения (tNGS) и секвенирования 16S рибосомной РНК (рРНК) для сравнения патогенов и микробиоты. Сначала сравнивались разнообразия микробиоты между верхними и нижними дыхательными путями. Затем анализировалось разнообразие микробиоты нижних дыхательных путей среди различных групп патогенов и групп исхода. Высокая согласованность была наблюдена между первым патогеном, обнаруженным в верхних и нижних дыхательных путях у детей с ППС по tNGS. Индексы разнообразия были выше в верхних дыхательных путях, чем в нижних дыхательных путях у детей с ППС. Индексы богатства верхних дыхательных путей были выше в группе с постоянными ведущими патогенами между верхними и нижними дыхательными путями. Инфекция была связана с уменьшением разнообразия микробиоты нижних дыхательных путей по сравнению с группами бактерий и вирусов. Группа с кислородом показала более высокую распространенность, с наибольшей репрезентативной микробиотой в этой группе.

Несмотря на значительное влияние длительного использования пневмококковой конъюгированной вакцины (PCV) для детей в Великобритании, бремя болезней, вызванных пневмококками, остается значительным. Вакцины с более высоким валентным составом, такие как 20-валентная PCV (PCV20), могут снизить это бремя, однако их ценность в современных условиях Великобритании не была полностью оценена с использованием свежих данных. Возрастная динамическая модель передачи использовала эпидемиологические данные Великобритании после COVID-19 (2001-2023) для сравнения педиатрических схем вакцинации PCV20 (2+1 и 1+1) с PCV13 (1+1) и PCV15 (1+1). На протяжении 10 лет мы оценивали эффективность затрат и количество, необходимое для вакцинации (NNV), учитывая случаи заболеваний, смерти, затраты, скорректированные по качеству жизни (QALYs) и предельные коэффициенты эффективности затрат. Анализ чувствительности и сценариев изучил ключевые неопределенности. В течение 10 лет обе схемы PCV20 оказались более предпочтительными по сравнению с PCV13 и PCV15. В сравнении с PCV13, PCV20 1+1 и 2+1, по прогнозам, смогут предотвратить 448 432 и 499 151 случаев заболеваний и сэкономить соответственно 1,509 и 1,306 миллиарда фунтов стерлингов. По сравнению с PCV15, PCV20 1+1 и 2+1, по прогнозам, предотвратят 409 459 и 460 179 случаев заболеваний и сэкономят соответственно 1,424 и 1,221 миллиарда фунтов стерлингов. NNV для PCV20 были ниже, чем для PCV15 для обеих схем вакцинации. Результаты анализа чувствительности и сценариев были последовательны с базовым случаем. Внедрение педиатрической PCV20 в Великобритании может обеспечить значительные преимущества для здоровья при повышении экономической эффективности.

Обширные доказательства подтверждают высокую эффективность вакцин против вируса папилломы человека (ВПЧ) у молодых девушек; однако данные о реальной эффективности вакцины (ЭВ) среди женщин, привитых в возрасте от 18 до 45 лет, остаются ограниченными, особенно в Китае, где состояние ВПЧ на момент вакцинации часто неизвестно. Мы провели основанное на популяции исследование с использованием дизайна «тест-отрицательный» с соответствующими контрольными группами, используя связанные записи оScreening раке шейки матки и вакцинации в Шэньчжэне, Китай. Случаи с положительным результатом на высокоонкогенные типы ВПЧ (группа hrHPV) были сопоставлены 1:1 с отрицательными контрольными группами по возрасту, дате скрининга, регистрации по месту жительства и типу скрининга. Эффективность вакцины для хотя бы одной дозы была оценена с использованием условной логистической регрессии и стратифицирована по времени после вакцинации, валентности вакцины и возрасту на момент вакцинации. Среди 7060 сопоставленных пар общая ЭВ значительно увеличивалась с течением времени после вакцинации: 6,4% (95% ДИ: -3,9% до 15,7%) через менее чем год, 17,9% (5,5% до 28,7%) на 1-<2 года и 40,2% (29,6% до 49,2%) на 2 года и более. Среди женщин, вакцинированных не менее 2 лет назад, ЭВ против ВПЧ16/18 составила 48,4% (33,7% до 59,8%) для 2-/4-valent вакцин и 54,4% (26,5% до 71,7%) для 9-valent вакцины. Значительная защита на 2 год и более была зарегистрирована среди всех групп по возрасту на момент вакцинации: 45,7% (25,0% до 60,7%) для возрастной группы 18-26 лет, 39,6% (23,5% до 52,4%) для возрастной группы 27-35 лет и 35,5% (12,6% до 52,4%) для возрастной группы 36-45 лет. В заключение, вакцинация против ВПЧ обеспечивает умеренную защиту от положительности ДНК высокоонкогенных типов ВПЧ среди китайских женщин, привитых в возрасте от 18 до 45 лет. Тем не менее, поскольку этот результат отражает лишь одноразовый косвенный вирологический конечный пункт, а не персистирующую инфекцию или клиническое заболевание, взрослые женщины должны продолжать регулярные обследования на рак шейки матки.

Высокие затраты и сбои в цепочке поставок представляют собой реальные проблемы для внедрения децентрализованных молекулярных платформ для обнаружения МБТ (Mycobacterium tuberculosis) в условиях ограниченных ресурсов. В данном исследовании была оценена стоимость, осуществимость и приемлемость интеграции анализов Cobas MTB и MTB-RIF/INH (Roche Diagnostics GmBH, Мангейм, Германия) в потоки высокопроизводительного тестирования на ВИЧ с использованием системы Cobas 8800 в округе Бусия, Кения. Данные о количестве образцов и тестирований были собраны в больнице Порт Виктория. Остаточные образцы мокроты (≈ 1208), собранные для тестирования на децентрализованной платформе GeneXpert (Cepheid, Санта-Клара, Калифорния, США) (стандартное обслуживание), были проанализированы на централизованной системе Cobas 8800. Затраты на единицу были оценены с использованием подхода на основе ингредиентов, параметризованного в Модели стоимости тестовой платформы, с использованием данных реального объема тестирования. Осуществимость и приемлемость интегрированного тестирования на системе Cobas 8800 были оценены с помощью качественных опросов и анализа рабочих процессов. Интегрированная высокопроизводительная система Cobas 8800 поддерживала стабильные объемы тестирования (медиана, 94 образца/день), в то время как объем тестирования на децентрализованных платформах GeneXpert был спорадическим (медиана, четыре образца/день) из-за сбоев в цепочке поставок и отсутствия запасов. Затраты на единицу интегрированного подхода варьировались от 16,04 доллара США (в сценарии наилучшего случая) до 18,97 долларов США (в сценарии наихудшего случая). Затраты на единицу GeneXpert составили 23,53 доллара США при ожидаемом использовании и 78,63 доллара США в наихудшем случае. Осуществимость и приемлемость были высокими. Это исследование проводилось в округе Бусия, Кения, что потенциально ограничивает обобщаемость результатов для регионов с другой системой здравоохранения или объемами тестирования. Анализ не оценивал клиническое воздействие (например, время до начала лечения) и предполагал наличие недоиспользуемой мощности на существующих высокопроизводительных платформах. Интеграция молекулярного тестирования на МБТ в устоявшиеся высокопроизводительные потоки тестирования на ВИЧ обеспечила большую экономическую стабильность по сравнению с децентрализованной инфраструктурой и была осуществима и приемлема для лабораторного персонала. Стратегическое масштабирование интегрированной высокопроизводительной диагностики для дополнения тестирования на месте может смягчить волатильность затрат, оптимизировать недоиспользуемую мощность тестирования и помочь сократить национальный разрыв в диагностике туберкулеза в условиях высокого бремени и ограниченных ресурсов.