Геномный ландшафт и филогенетические аспекты более чем двух десятилетий в Южном Китае и его глобальный мониторинг.
Genomic landscape and phylogenetic insights ofover two decades in southern China and its global surveillance.
Карточка статьи
- Рубрика
- Медицина
- Источник
- PubMed
- DOI
- 10.1080/22221751.2026.2691358
- Дата
- 01.12.2026
- Автор
- Science Morning
- Время чтения
- 3 мин

Аннотация
Мелиоидоз, вызванный Burkholderia pseudomallei, является эндемичным инфекционным заболеванием с высокой летальностью в тропических и субтропических регионах. В Китае недостаточно обширных эпидемиологических данных, в то время как комплексные данные с интеграцией геномной эпидемиологии встречаются редко во всем мире. В данном исследовании был проведен ретроспективный анализ 554 случаев мелиоидоза с подтвержденной культурой в Южном Китае с 2003 по 2022 год. Были проанализированы геномные характеристики и их связь с антимикробной чувствительностью и клиническими характеристиками с помощью секвенирования всего генома. Филогении на основе SNP основного генома были построены из выровненных данных с маской рекомбинации и сравнены с 3573 общественно доступными глобальными геномами для определения их популяционной структуры и филогеографических паттернов. Мелиоидоз в основном поражал мужчин (86,8%, 481/554) и людей в возрасте от 45 до 64 лет (57,7%). Бактериемия (OR=5,91, <0,001), сахарный диабет (OR=2,27, =0,008) и легочная инфекция (OR=2,26, =0,005) были определены как факторы риска для летальности. Тестирование антимикробной чувствительности показало высокую чувствительность к имипенему (100%) и цефтазидиму (99,6%). Анализ пангенома подтвердил хромосомную функциональную разделенность двучастного генома, а геномное исследование ассоциаций выявило высоконадежные генетические маркеры (OR >3 или <0,33), существенно связанные с летальностью и бактериемией. Более того, глобальный филогеномный анализ выявил 10 эволюционных кластеров; изоляты из Китая были значительно обогащены в Кластере 1, который образует клад, общую с тайскими штаммами, и были филогенетически отличны от Кластера 5, в который в основном входили австралийские изоляты. В заключение, данное крупномасштабное геномное и клиническое исследование предоставляет самый полный обзор мелиоидоза в Южном Китае. Геномный анализ подчеркнул значительное региональное и глобальное генетическое разнообразие и филогеографическую структуру, подчеркивая важность продолжения геномного мониторинга.
Краткое резюме
Данное исследование представляет собой обширный анализ мелиоидоза в Южном Китае, выявляя ключевые геномные характеристики и их связь с клиническими исходами. Показано, что заболевание преимущественно затрагивает мужчин среднего возраста, с важными факторами риска, такими как наличие сахарного диабета и легочных инфекций. Геномный анализ также демонстрирует высокую чувствительность к антимикробным препаратам и генетическое разнообразие, что подчеркивает необходимость дальнейшего мониторинга заболеваний.
Практический вывод
Необходимость постоянного геномного мониторинга мелиоидоза в целях улучшения профилактических и лечебных стратегий, особенно в эндемичных регионах.
Ограничения
Исследование ограничено данными только из Южного Китая и не охватывает другие регионы, что может повлиять на обобщаемость результатов. Кроме того, некоторые клинические факторы могут быть недооценены из-за отсутствия информации в медицинских записях.

