МедицинаPubMedScience Morning3 мин чтенияcohort study

Геномный ландшафт и филогенетические аспекты более чем двух десятилетий в Южном Китае и его глобальный мониторинг.

Genomic landscape and phylogenetic insights ofover two decades in southern China and its global surveillance.

Рубрика
Медицина
Источник
PubMed
DOI
10.1080/22221751.2026.2691358
Дата
01.12.2026
Автор
Science Morning
Время чтения
3 мин
Медицина

Аннотация

Мелиоидоз, вызванный Burkholderia pseudomallei, является эндемичным инфекционным заболеванием с высокой летальностью в тропических и субтропических регионах. В Китае недостаточно обширных эпидемиологических данных, в то время как комплексные данные с интеграцией геномной эпидемиологии встречаются редко во всем мире. В данном исследовании был проведен ретроспективный анализ 554 случаев мелиоидоза с подтвержденной культурой в Южном Китае с 2003 по 2022 год. Были проанализированы геномные характеристики и их связь с антимикробной чувствительностью и клиническими характеристиками с помощью секвенирования всего генома. Филогении на основе SNP основного генома были построены из выровненных данных с маской рекомбинации и сравнены с 3573 общественно доступными глобальными геномами для определения их популяционной структуры и филогеографических паттернов. Мелиоидоз в основном поражал мужчин (86,8%, 481/554) и людей в возрасте от 45 до 64 лет (57,7%). Бактериемия (OR=5,91, <0,001), сахарный диабет (OR=2,27, =0,008) и легочная инфекция (OR=2,26, =0,005) были определены как факторы риска для летальности. Тестирование антимикробной чувствительности показало высокую чувствительность к имипенему (100%) и цефтазидиму (99,6%). Анализ пангенома подтвердил хромосомную функциональную разделенность двучастного генома, а геномное исследование ассоциаций выявило высоконадежные генетические маркеры (OR >3 или <0,33), существенно связанные с летальностью и бактериемией. Более того, глобальный филогеномный анализ выявил 10 эволюционных кластеров; изоляты из Китая были значительно обогащены в Кластере 1, который образует клад, общую с тайскими штаммами, и были филогенетически отличны от Кластера 5, в который в основном входили австралийские изоляты. В заключение, данное крупномасштабное геномное и клиническое исследование предоставляет самый полный обзор мелиоидоза в Южном Китае. Геномный анализ подчеркнул значительное региональное и глобальное генетическое разнообразие и филогеографическую структуру, подчеркивая важность продолжения геномного мониторинга.

Краткое резюме

Данное исследование представляет собой обширный анализ мелиоидоза в Южном Китае, выявляя ключевые геномные характеристики и их связь с клиническими исходами. Показано, что заболевание преимущественно затрагивает мужчин среднего возраста, с важными факторами риска, такими как наличие сахарного диабета и легочных инфекций. Геномный анализ также демонстрирует высокую чувствительность к антимикробным препаратам и генетическое разнообразие, что подчеркивает необходимость дальнейшего мониторинга заболеваний.

Практический вывод

Необходимость постоянного геномного мониторинга мелиоидоза в целях улучшения профилактических и лечебных стратегий, особенно в эндемичных регионах.

Ограничения

Исследование ограничено данными только из Южного Китая и не охватывает другие регионы, что может повлиять на обобщаемость результатов. Кроме того, некоторые клинические факторы могут быть недооценены из-за отсутствия информации в медицинских записях.

Похожие исследования

Подборка учитывает рубрику, ключевые слова, аннотацию, резюме, практические выводы и источник.

Медицина
Медицина
92%

Периферийный иммунный ландшафт человеческого рака молочной железы.

Клиническое управление пациентами с раком молочной железы в значительной мере определяется стадией опухоли, подтипом заболевания и (по крайней мере в некоторых случаях) специфическими молекулярными особенностями (мутациями, позитивностью PD-L1). Однако не все пациенты с раком молочной железы реагируют на терапевтические подходы, которые точно нацелены на их заболевание. Это может частично объясняться тем фактом, что опухоли молочной железы имеют высокую гетерогенность с точки зрения широкой иммунологической перспективы, даже когда они демонстрируют схожие подтипы заболевания и молекулярные характеристики. Таким образом, интеграция дополнительных иммунологических параметров в существующие алгоритмы принятия решений может значительно улучшить клиническое управление этой большой популяцией пациентов. В этом контексте циркулирующие показатели глобальной иммунной готовности и текущего антитуморного иммунитета выделяются как особенно перспективные инструменты для минимально инвазивной прогностической и/или предсказательной оценки. Здесь мы резюмируем и критически обсуждаем циркулирующий иммунный ландшафт человеческого рака молочной железы, по мере возможности сравнивая по подтипам заболевания, стадиям и результатам лечения.

Медицина
Медицина
82%

Является ли ключевым медиатором между оральными инфекциями и системными заболеваниями? Механистические аспекты и терапевтические последствия.

выступает как патобионт, который связывает оральную дисбиозу с системными заболеваниями через коагрегацию, гематогенное распространение и модуляцию иммунного ответа. Этот обзор предоставляет молекулярные сведения о том, как они участвуют в системных заболеваниях, таких как рак толстой кишки, неблагоприятные исходы беременности, сердечно-сосудистые заболевания, нейродегеративные расстройства и диабет mellitus. Ключевыми факторами вирулентности являются адгезины FadA, Fap2 и RadD, липополисахариды и везикулы наружной мембраны, которые способствуют эпителиальной инвазии и проницаемости эндотелия, а также способствуют подавлению иммунного ответа через сигнальные пути TLR4-NF-κB, β-катенин/Wnt и MAPK. Эти взаимодействия приводят к нарушению гомеостаза тканей, поддерживают хроническое воспаление и способствуют онкогенному и метаболическому модифицированию. Системная плейотропия further substantiated by its involvement in chemoresistance, placental dysfunction, vascular inflammation, and neuronal injury, substantiating its systemic pleiotropy. Появляющиеся терапевтические стратегии, такие как блокировка адгезинов, нейтрализация везикул наружной мембраны, манипуляции с микробиомом и использование методов очистки на основе CRISPR, обеспечивают прецизионные методы для смягчения заболеваний. Таким образом, этот обзор идентифицирует как основной микробный медиатор орально-системной патологии и его трансляционное значение в разработке целевых антимикробных и направленных на хозяина терапий.

Медицина
Медицина
77%

Картирование иммунного ландшафта при мелкоклеточном раке легкого выявляет уникальную молекулярную сигнатуру опухле-реактивных CD8+ T-клеток

Мелкоклеточный рак легкого (МРЛ) — это высокоагрессивная злокачественная опухоль с ограниченными терапевтическими достижениями. В отличие от многих других видов рака, его иммунный ландшафт, особенно иммунная компетенция и распознавание T-клеток, остается недостаточно изученным. Здесь мы создали атлас транскриптома отдельных клеток иммунной микросреды МРЛ с парным секвенированием T-клеточных рецепторов (TCR). Связывая состояния T-клеток с клональностью и многослойным функциональным скринингом, мы идентифицировали 6 опухле-реактивных TCR, которые распознают и уничтожают аутологичные клеточные линии МРЛ. Мы описали новую сигнатуру CD8+ T-клеток, реактивных на МРЛ (SCLC_TR), что позволяет идентифицировать 47 дополнительных опухле-реактивных TCR. Сигнатура SCLC_TR показывает исключительные результаты в аденокарциноме поджелудочной железы (ПДК), еще одной опухоли с холодной иммунной реакцией, и, что особенно примечательно, пациенты с повышенными баллами по сигнатуре SCLC_TR демонстрируют значительно улучшенное выживание, подчеркивая ее прогностический потенциал. Сравнительный анализ взаимодействия клетка-клетка указывает на несколько иммунодепрессивных механизмов, при этом миелоидные клетки и CD4+ регуляторные T-клетки, возможно, выступают в роли противовесов для активности эффекторных T-клеток при МРЛ. В заключение, наше исследование бросает вызов устоявшемуся мнению о МРЛ как о опухоли с холодной иммунной реакцией, предоставляя прямые доказательства опухле-реактивных T-клеточных ответов и вводя сигнатуру SCLC_TR как инструмент для идентификации опухле-специфических T-клеток и их микросредовых ограничений и механизмов уклонения, в конечном итоге формируя стратегии иммунотерапии следующего поколения.

Медицина
Медицина
72%

Два контрастных случая меккелевского дивертикула у детей, не выявляемых сцинтиграфией, идентифицированных и локализованных с помощью кишечного ультразвука и двойной баллонной энтероскопии: отчет о двух случаях.

Меккелевский дивертикул (МД), не выявляемый сцинтиграфией, представляет собой диагностическую проблему у детей, особенно когда подлежащая патология различается между случаями. Сцинтиграфия с технецием-99m-метоксипропиленгликолем широко используется для диагностики; тем не менее, возможны ложноположительные результаты, когда экто́пическая желудочная слизистая отсутствует или когда дивертикул инвертирован. Мы сообщаем о двух детских случаях с контрастными меккелевскими дивертикулами, не выявляемыми сцинтиграфией, в которых кишечный ультразвук (КУЗ) показал целевые поражения, а двойная баллонная энтероскопия (ДБЭ) позволила провести прямую диагностику и предоперационную локализацию. Первый случай — 13-летний мальчик с рецидивирующей abdominal болью и гемато́хезией. КУЗ выявил локализованное утолщение стенки подвздошной кишки с гиперэхогенной полиповидной образованием, и трансанальная ДБЭ определила педункулированную язвенную массу примерно в 80 см проксимальнее илеоцекального клапана. Хирургическая патология подтвердила инвертированный МД с экто́пической желудочной слизистой. Второй случай — 11-летняя девочка с рецидивирующей abdominal болью, изначально леченной как илеит. КУЗ показал локализованное утолщение стенки подвздошной кишки с увеличенной васкуляризацией и слепым трубчатым образованием, а ДБЭ показала двойной просвет, состоящий из истинного илеального просвета и слепого дивертикуллярного просвета. Патология подтвердила МД без экто́пической слизистой. ДБЭ позволила провести прямую диагностику и предоперационную маркировку без осложнений в обоих случаях. Эти случаи предполагают, что КУЗ может помочь в идентификации целевых поражений, а ДБЭ полезна для окончательной диагностики и предоперационной локализации у детей с подозрением на МД, несмотря на отрицательную сцинтиграфию.

Медицина
Медицина
72%

Метастазирование лейомиосаркомы матки в желудок, выявленное во время эндоскопического наблюдения и резектированное с помощью эндоскопической подслизистой диссекции после множественных метахронных метастазов: клинический случай.

Лейомиосаркома матки (uLMS) является редким, агрессивным злокачественным новообразованием матки, которое обычно метастазирует гематогенно, в то время как желудочно-кишечное вовлечение встречается редко. 69-летняя женщина с диагнозом uLMS, прошедшая лечение в виде гистерэктомии и адъювантной химиотерапии, развила метахронные метастазы в легкие, сигмовидную кишку, желчный пузырь и стенку живота. После лечения этих метастазов периодическое эндоскопическое наблюдение выявило субэпителиальную опухоль размером 15 мм с неглубокой центральной депрессией в нижней части желудка. Эндоскопическая ультрасонография показала четко очерченное подслизистое образование без инвазии мышечной оболочки, а биопсия подтвердила метастатическую лейомиосаркому. Была проведена эндоскопическая подслизистая диссекция (ESD), которая позволила выполнить резекцию en bloc без adverse событий. Эта редкая метахронная комбинация желудочных, колонических и желчнопузырных метастазов подчеркивает, что случайное метастазирование в желудок может происходить на протяжении длительного течения заболевания и предполагает, что ESD может быть полезной минимально инвазивной опцией для локального контроля небольших желудочных метастазов.

Медицина
Медицина
72%

Оценка больших языковых моделей в клиническом управлении пациентами с верхним желудочно-кишечным кровотечением: данные из реальной практики.

Для оценки больших языковых моделей (БЯМ) в предэндоскопической (ПЭ) стратификации риска и предсказании эндоскопических находок при кровотечении из верхних отделов желудочно-кишечного тракта (КВУГЖ), а также для сравнения их эффективности с клиническими шкалами риска, традиционными моделями машинного обучения (МО) и гибридными подходами. Это многоцентровое ретроспективное исследование включало 384 пациента с КВУГЖ, которые прошли эндоскопию. Пять БЯМ были протестированы с использованием структурированных нулевых запросов на основе клинических и лабораторных данных ПЭ. Их эффективность в выявлении пациентов с высоким риском была сопоставлена с шкалой Глазго-Блэтчфорда (GBS), AIMS65, шкалой Рокалла для ПЭ и моделями МО. Также были оценены гибридные модели БЯМ-шкала. Два гастроэнтеролога оценили качество обоснований, сгенерированных БЯМ. GBS показала наилучшие дискриминационные показатели среди клинических шкал (площадь под кривой операционной характеристикой [AUROC] 0.73). Среди БЯМ GPT-5 достиг наивысшей точности (0.66), в то время как Grok продемонстрировала наилучшие сбалансированные показатели (0.59; F1 0.47). Gemini-2.5-Flash имела наивысшую чувствительность (0.89), но низкую специфичность (0.21). Эндоскопические предсказания имели скромную производительность, при этом Gemini-2.5-Flash достигла наивысшей точности точного соответствия (0.34) и микро-F1 (0.38). Гибридные модели улучшили результаты по сравнению с отдельными БЯМ, но не превзошли GBS (лучший: GBS+GPT-5, AUROC 0.67). БЯМ показали более высокие численные показатели по сравнению с традиционными моделями МО, но статистическое сравнение было невозможно из-за отсутствия данных на уровне экземпляров. Grok получила наивысший балл человеческой оценки за качество объяснений. БЯМ показали умеренное качество в стратификации риска КВУГЖ и предсказании эндоскопии, но уступили клиническим шкалам, особенно GBS. Гибридные модели немного улучшили показатели по сравнению с отдельными БЯМ, но не превзошли GBS, поддерживая их использование как вспомогательных инструментов, а не систем поддержки клинического решения.