Роль ZEB1 в ангиогенезе и терапевтический потенциал (Обзор)

Трансляция кишечных бактерий в кровоток является путем инфекции для позднего сепсиса (ПС) у недоношенных детей, подчеркивая потенциал профилирования фекальной микробиоты для ранней стратификации риска. Наша цель заключалась в выявлении и валидации специфических сигнатур кишечной микробиоты для ПС. Пятьдесят восемь недоношенных детей (срок гестации < 30 недель) с подтвержденным микробиологическим анализом ПС (исключая коагулазонегативные стафилококки) были сопоставлены с контрольной группой (1:1) в трех когортах (Открытие (DC) = 18; Валидация 1 и 2; VC1 = 12, VC2 = 28). Фекальные образцы, собранные до 10 дней до начала ПС, подвергались секвенированию гена 16S рРНК. Сравнивались микробный состав, разнообразие и дискриминационные таксоны среди подгрупп ПС. Модели Random Forest (RF) были обучены в DC и валидированы в VC1/VC2. Вариация микробиоты в значительной степени объяснялась патогеном ПС (R = 17%, <0.001). У детей с нестафилококковым ПС наблюдалось временное увеличение относительной абундантности. Модель RF, различающая ПС и контрольную группу, показала наивысшую дискриминационную способность (AUC = 0.99/0.78/0.61 для DC/VC1/VC2) по сравнению с нестафилококковым ПС (AUC = 0.96/0.46/0.41). Наши результаты показывают значительные сдвиги микробиоты, предшествующие ПС, с более высокой дискриминационной способностью по сравнению с нестафилококковым ПС. Хотя специфическая для патогена микробиота может предложить дополнительную клиническую ценность, сниженная производительность валидации подчеркивает ограниченную обобщаемость и подчеркивает необходимость дальнейших исследований перед клиническим применением.

Арбовирусы, включая клещей, блох и вшей, были обнаружены как инфицированные Rickettsia massiliae, патогенным представителем группы пятнистой лихорадки, вызывающим риккетсиоз. Этот всеобъемлющий обзор обобщает известные факты о передаче, методах диагностики, филогенетическом положении, отчетах о случаях заболевания у людей, мерах профилактики и распространении в Палеарктическом и Ориентальном регионах. Для составления этого исследования были предприняты три основных шага: объяснение целей, идентификация соответствующей литературы и получение данных, определенных по критериям включения и исключения. Были исследованы различные базы данных на предмет релевантной литературы. Наши цели заключались в сборе данных о методах передачи R. massiliae, методах идентификации, филогенетическом положении, клинических отчетах по всему миру и распространении через возможных векторов и хост-животных, обитающих в Палеарктическом и Ориентальном регионах. Проведен описательный анализ, который позволил построить графики частоты зарегистрированных случаев в различных странах и среди различных хозяев. Выявлено, что R. massiliae была обнаружена в Палеарктическом и Ориентальном регионах в 5 родах клещей (Rhipicephalus, Hyalomma, Haemaphysalis, Ixodes, Amblyomma и Dermacentor), 1 роду вшей (Haematopinus), 1 роду овечьих вшей (Melophagus) и 1 роду блох (Archaeopsylla), хотя их роль в качестве векторов все еще неизвестна. Собаки, овцы, крупный рогатый скот и козы были зарегистрированы как эпидемиологически важные хост-животные для зараженных арбовирусов в 30, 23, 17 и 16 различных исследованиях соответственно, что подчеркивает их роль в возможной передаче. Кроме того, Rh. sanguineus sensu lato и Rh. turanicus были зарегистрированы как паразиты у упомянутых животных, что также признается потенциальным вектором для их передачи. Наибольшее количество сообщений о R. massiliae (10) из различных животных и векторов было зарегистрировано в Китае. Италия зарегистрировала наибольшее число (3) клинических случаев у людей на сегодняшний день. Более того, методы передачи, такие как трансоваарное через Rh. turanicus и горизонтальная/искусственная подкормка через Rh. sanguineus и различные диагностические методы для R. massiliae были задокументированы. R. massiliae широко документирована по всему Палеарктическому и Ориентальному регионам, при этом случаи заболевания у людей зарегистрированы в около шести странах. Rh. sanguineus и Rh. turanicus выделяются как потенциальные векторы, в то время как дальнейшие исследования имеют значение для разнообразного спектра арбовирусов в эпидемиологии этой бактерии.

Желудочно-кишечное кровотечение (ЖКК) является одной из основных причин заболеваемости при болезни фон Виллебранда (БВВ), чаще всего возникающей в результате ангиодисплазии. Современные алгоритмы диагностики необъяснимых желудочно-кишечных кровотечений (НЖКК) в основном основаны на анатомических данных и часто упускают из виду скрытые гемостатические расстройства, что задерживает диагностику и способствует рецидивирующим кровотечениям. Этот обзор суммирует текущие данные о молекулярных механизмах, диагностике и лечении ЖКК, ассоциированного с БВВ, и предлагает ориентированную на механизмы диагностическую структуру. Мы провели всесторонний нарративный обзор экспериментальных, трансляционных и клинических исследований, сосредоточив внимание на наследственном БВВ, приобретенном синдроме фон Виллебранда (АСВ), гастроинтестинальной ангиодисплазии, эндотелиальной биологии и стратегиях диагностики и лечения. Нехватка или дисфункция многиммерного фактора фон Виллебранда (ФВВ) высокомолекулярной массы способствует ангиодисплазии, нарушая гомеостаз телец Вейбела-Паладо, усиливая сигналы Ang-2/Tie2 и VEGF, нарушая функцию интегрина αvβ3 и способствуя активации эндотелия, связанной с воспалением. Генетические и эпигенетические модификаторы, включая FLI1, STXBP5, группу крови ABO и miR-24, дополнительно влияют на сосудистую восприимчивость. Опираясь на эти механизмы, мы предлагаем четырехступенчатую диагностическую структуру, объединяющую оценку кровотечения, скрининг функций тромбоцитов и целевое тестирование ФВВ с традиционной эндоскопической оценкой для более раннего выявления БВВ/АСВ у пациентов с рецидивирующими или необъяснимыми ЖКК. Эта стратегия поддерживает лечение на основе механизмов, комбинируя гемостатические репаративные терапевтические стратегии с избранными антиангиогенезными подходами. ЖКК, ассоциированное с БВВ, следует рассматривать как системное сосудисто-гемостатическое расстройство, а не как изолированное структурное гастроинтестинальное заболевание. Интеграция гемостатической оценки в пути НЖКК может повысить точность диагностики, снизить количество ненужных процедур и обеспечить персонализированное управление пациентами с рецидивирующими кровотечениями.

Аденокарцинома поджелудочной железы (ПДЖ) является одним из самых агрессивных злокачественных новообразований у человека и имеет крайне неблагоприятный прогноз. Ее прогрессирование в значительной степени обусловлено крайне сложным и иммунодепрессивным микротройным окружением (МТО), что подчеркивает срочную необходимость в более глубоком понимании ее молекулярных механизмов. Недавние достижения в области секвенирования РНК на уровне единой клетки (scRNA-seq) и пространственной транскриптомики (ST) предоставили беспрецедентные возможности для анализа клеточной гетерогенности, пространственной организации и динамики экспрессии генов в рамках МТО. В этом обзоре мы суммируем основные технологии scRNA-seq и ST, а также их уникальные преимущества в исследовании рака, и подчеркиваем их интегрированные применения в раскрытии гетерогенности ПДЖ, взаимодействиях стромы и иммунной системы, а также механизмах терапевтической устойчивости. Мы также обсуждаем, как эти подходы могут способствовать открытию биомаркеров и направлять разработку новых терапевтических стратегий. В целом, эти результаты предполагают, что интегрированная единоклеточная и пространственная транскриптомика имеет трансформирующий потенциал для развития прецизионной онкологии и улучшения результатов лечения пациентов с раком поджелудочной железы.

Модификации РНК стали основными регуляторами контроля трансляции при раке. В отличие от транскрипционных перестроек, которые разворачиваются в течение часов, зависящее от модификаций перекрытие трансляции позволяет быстро адаптировать протеом к неблагоприятному микросреде опухоли с дефицитом питательных веществ, гипоксией и иммунологическим давлением. Тем не менее, большинство существующих обзоров структурируют механизмы эпитранскриптомики по типу модификаций или признакам рака, что затрудняет понимание механистической логики, по которой химические метки коллективно изменяют трансляционный аппарат. Этот обзор принимает ориентированный на трансляцию подход, исследуя, как наиболее распространенные модификации на мРНК, тРНК и рРНК регулируют каждую стадию синтеза белка в злокачественных клетках. Мы рассматриваем инструменты эпитранскриптомики, включая химические структуры модификаций, ферментные «писатели», «читатели» и «стиратели», а также технологии детекции, включая секвенирование РНК с использованием нанопор. Затем мы проследим, как модификации контролируют инициацию (циркуляция мРНК под управлением м6A, кап-зависимая трансляция eIF3 и eIF4G2, переключение капы на IRES под управлением 2'-O-метилирования рРНК), элонгацию (остановка рибосом, вызванная м6A, связанная с распадом мРНК, трансляция с уклоном в кодоны с участием тРНК mcm5s2U, набор фактора элонгации, зависящий от YTHDF1) и терминацию (чтение стоп-кодона через псевдоуридинизирование, избегание NMD). Критически важно отметить, что модификации мРНК, тРНК и рРНК не действуют изолированно, а формируют интегрированные сети. Например, м6A на мРНК и tRNA mcm5s2U действуют на противоположных сторонах одной и той же регуляторной оси, что имеет прямые последствия для разработки терапии. Мы оцениваем растущий портфель лекарств, начиная от ингибитора METTL3 STC-15, который сейчас находится на испытаниях 1b/2 фазы, и PROTAC для нацеливания на METTL3, до ингибиторов FTO и ADAR1, и утверждаем, что стратегии комбинированного лечения, основанные на биологии, нацеливающиеся на несколько осей модификаций, будут необходимы для обеспечения долговременного клинического ответа.

Болезнь Кавасаки (БК) - это системный васкулит у детей, который прежде всего поражает коронарные артерии, и исследования предполагают, что кишечная микробиота может играть роль в патогенезе БК, воспалительных реакциях и регуляции иммунной системы. В данном исследовании использована интегративная стратегия мульти-омики для систематического изучения взаимодействий микробиоты кишечника и метаболитов при БК. Ключевые молекулярные мишени были определены с помощью сетевых анализов и моделей машинного обучения, с использованием менделевской рандомизации для подтверждения причинности. Транскриптомика одноядерных клеток и молекулярное мазание дополнительно прояснили взаимодействия иммунных клеток и связывание метаболитов с белками, подчеркивая ключевые регуляторные пути. Мы определили SELP как основную молекулярную мишень при БК, преимущественно экспрессируемую в тромбоцитах и участвующую в иммунных и воспалительных реакциях. Метаболиты, полученные из кишечной микробиоты, включая пальмитоилэтаноламид, пантотеновую кислоту и 1-О-коричневый глицерин, могут регулировать взаимодействия иммунных клеток через сигнальный путь RESISTIN. Измененные обилии микробных таксонов, таких как , и предполагают их потенциальную роль в модуляции воспаления. Активация путей IL-17, TNF, MAPK и PI3K-Akt дополнительно способствует прогрессированию заболевания, подчеркивая ось микробиота-метаболит-SELP как потенциальную терапевтическую мишень при БК. Эти результаты закладывают основу для последующих и исследований, продвигая разработку стратегий вмешательства на основе микробиома.