МедицинаbioRxivRagothaman, S., Reddy, R., Sajan, S. C., John, L. A. et al.3 мин чтенияpreprint
Органы, полученные от пациентов, функционально стратифицируют эпителиальный рак яичников на клинически значимые фенотипы ответа на химиотерапию
Patient-Derived Organoids Functionally Stratify Epithelial Ovarian Cancer into Clinically Relevant Chemotherapy Response Phenotypes
Карточка статьи
Рубрика
Медицина
Источник
bioRxiv
DOI
10.64898/2026.06.10.731260
Дата
07.07.2026
Автор
Ragothaman, S., Reddy, R., Sajan, S. C., John, L. A. et al.
Время чтения
3 мин
Это предварительная публикация, она не прошла научное рецензирование.
Аннотация
Фон. Рак яичников (РЯ) демонстрирует значительную гетерогенность в ответе на платиновые химиопрепараты, что приводит к переменным клиническим результатам и частым рецидивам. Текущие биомаркеры, такие как концентрация CA-125 в сыворотке и статус мутации BRCA, неполностью предсказывают терапевтический ответ. Мы исследовали, могут ли органы, полученные от пациентов (ОПП), функционально стратифицировать чувствительность к химиотерапии и лучше отражать клиническое поведение, специфичное для пациента.
Методы. В исследование были включены двадцать пациентов с РЯ, проходивших лечение в период с января 2024 года по май 2026 года, из которых были успешно установлены четырнадцать линий ОПП. Восемь ОПП с надежным расширением при низком проходе и всеобъемлющим длительным наблюдением подверглись функциональному профилированию по отношению к карбоплатину, паклитакселу, олапарибу и доксорубицину. Ответы на препараты оценивались с использованием полумаксимальной ингибирующей концентрации (IC50) и интегральной площади под кривой (AUC) и объединялись с радиологическим ответом, кинетикой CA-125 в сыворотке, статусом BRCA и беспрерывной выживаемостью (PFS).
Результаты. Клинические исходы значительно варьировались, несмотря на схожие режимы лечения с платиной и таксанами. Хотя снижение CA-125 после лечения было связано с увеличением PFS, ни кинетика CA-125, ни статус мутации BRCA последовательно не предсказали терапевтический ответ. Функциональная стратификация, основанная на ОПП, разделила опухоли на четыре клинически значимых фенотипа ответа на платину и таксаны: двуочаговая чувствительность, чувствительность к платине/резистентность к таксану, резистентность к платине/чувствительность к таксану и двуочаговая резистентность. Эти функциональные категории близко отражали радиологический ответ, нормализацию CA-125 и паттерны прогрессирования заболевания. ОПП с низкими значениями IC50 и AUC были связаны с стойкой клинической выгодой, в то время как резистентные ОПП коррелировали с постоянным заболеванием и ранним рецидивом.
Выводы. Функциональная стратификация, основанная на ОПП, фиксирует клинически значимую терапевтическую гетерогенность в РЯ и дополняет традиционные биомаркеры, напрямую измеряя чувствительность опухоли к препарату. Перспективная интеграция тестирования ОПП может способствовать выбору терапии, специфичной для пациента, и поддерживать подходы функциональной прецизионной онкологии при раке яичников.
Краткое резюме
Исследование показало, что органы, полученные от пациентов, могут эффективно стратифицировать рак яичников по чувствительности к химиотерапии, лучше отражая индивидуальные характеристики заболевания по сравнению с традиционными биомаркерами.
Практический вывод
Использование органов, полученных от пациентов, может улучшить выбор терапии для пациентов с раком яичников, что приведет к более целенаправленным и эффективным методам лечения.
Ограничения
Это предварительная публикация, она не прошла научное рецензирование. Исследование включает ограниченное количество пациентов и зависит от успешного создания линий ОПП, что может не всегда быть возможно. Необходимы дальнейшие испытания для более точной оценки клинической применимости.
Цель данного исследования заключается в понимании восприятия и предоставления услуг по уходу за пережившими рак среди онкологических пациентов, а также в выявлении преград для качественного ухода. Результаты также предоставят инсайты, которые помогут Cancer Council NSW разработать рекомендации по политике, направленные на обеспечение комплексной поддержки для выживших на протяжении их пути после лечения. В исследовании был проведен перекрестный опрос среди выживших от рака в возрасте 18 лет и старше, которые завершили активное лечение (n = 209). Были собраны данные о опыте ухода за выжившими, преградах доступа и неудовлетворенных потребностях. Для анализа ассоциаций между результатами (удобство доступа к уходу, информация о поддерживающем уходе, эффективность ухода и неудовлетворенные потребности) и демографическими, социоэкономическими и клиническими предикторами использовались логистическая регрессия Фирта и порядковая регрессия. Большинство пациентов (64,2%) получили информацию о поддерживающих службах, и 72,2% сообщили, что их потребности удовлетворены, однако только 44,8% отметили, что доступ был легким. Уровень образования был значимо связан с эффективностью ухода после лечения; отсутствие плана ухода за пережившими рак было связано с более низкой воспринимаемой эффективностью ухода после лечения (откорректированный OR: 12,80, P < 0,001). Женщины сообщили о значительно больших трудностях в доступе к поддерживающим службам (откорректированный OR: 0,08, P = 0,004) по сравнению с мужчинами. Ключевыми преградами стали высокие расходы и длительное время ожидания записей на прием, особенно для психологической поддержки, физиологии упражнений и специализированного ухода. Для устранения преград в уходе за пережившими рак в Новом Южном Уэльсе необходимы целенаправленные политические интервенции, включая финансовую поддержку, улучшение доступа для различных полов и стандартизированные планы ухода за пережившими рак. Выводы помогают Cancer Council NSW выступать за рекомендации по политике, направленные на улучшение служб ухода за пережившими рак, обеспечивая равный доступ для всех выживших от рака.
Мелкоклеточный рак легкого (МРЛ) — это высокоагрессивная злокачественная опухоль с ограниченными терапевтическими достижениями. В отличие от многих других видов рака, его иммунный ландшафт, особенно иммунная компетенция и распознавание T-клеток, остается недостаточно изученным. Здесь мы создали атлас транскриптома отдельных клеток иммунной микросреды МРЛ с парным секвенированием T-клеточных рецепторов (TCR). Связывая состояния T-клеток с клональностью и многослойным функциональным скринингом, мы идентифицировали 6 опухле-реактивных TCR, которые распознают и уничтожают аутологичные клеточные линии МРЛ. Мы описали новую сигнатуру CD8+ T-клеток, реактивных на МРЛ (SCLC_TR), что позволяет идентифицировать 47 дополнительных опухле-реактивных TCR. Сигнатура SCLC_TR показывает исключительные результаты в аденокарциноме поджелудочной железы (ПДК), еще одной опухоли с холодной иммунной реакцией, и, что особенно примечательно, пациенты с повышенными баллами по сигнатуре SCLC_TR демонстрируют значительно улучшенное выживание, подчеркивая ее прогностический потенциал. Сравнительный анализ взаимодействия клетка-клетка указывает на несколько иммунодепрессивных механизмов, при этом миелоидные клетки и CD4+ регуляторные T-клетки, возможно, выступают в роли противовесов для активности эффекторных T-клеток при МРЛ. В заключение, наше исследование бросает вызов устоявшемуся мнению о МРЛ как о опухоли с холодной иммунной реакцией, предоставляя прямые доказательства опухле-реактивных T-клеточных ответов и вводя сигнатуру SCLC_TR как инструмент для идентификации опухле-специфических T-клеток и их микросредовых ограничений и механизмов уклонения, в конечном итоге формируя стратегии иммунотерапии следующего поколения.
Фон: Индукционные плюрипотентные стволовые клетки человека (hiPSCs) являются перспективным инструментом для сосудистого регенерирования, однако предварительные исследования часто основываются на клетках, полученных от новорожденных доноров, в то время как клинические приложения будут использовать клетки, полученные от пожилых людей. Несмотря на то, что влияние возраста донора на эффективность перепрограммирования изучалось, его влияние на функциональность эндотелиальных предшественников, полученных из hiPSC (hiPSC-EPs), остается неясным. Этот вопрос является основным в текущем исследовании. Методы и результаты: Мы получили EP от iPSCs, полученных от трех новорожденных доноров (ND) и трех зрелых доноров (MD), сопоставленных в соотношении 1:1 по полу и происхождению соматических клеток. Мы оценили их функциональные, эпигенетические и транскриптомные характеристики. Несмотря на более высокую выходность клеток CD34? из MD-iPSCs, MD-hiPSC-EP образовали плохо взаимосвязанные и не светлые сосудистые структуры в 3D-гидрогелях по сравнению с линиями новорожденных доноров (ND). В 2D-культуре MD-hiPSC-EP продемонстрировали сниженную плотность клеток и аномальную локализацию VE-Кадгерина. Анализ метилирования ДНК показал, что происхождение соматических клеток является доминирующим фактором вариации, однако были замечены постоянные отличия в метилировании генов, связанных с мезодермальным обязательством, ангиогенезом, ремоделированием экстрацеллюлярного матрикса и цитоскелетом между возрастными группами. Прогнозирование эпигенетического возраста показало, что MD-hiPSC-EP имели более зрелые сигнатуры, что потенциально объясняет их смещение от васкулогенной компетенции. Наши результаты по RNA-секвенированию подтверждают тенденции, наблюдаемые в данных по метилированию ДНК, и показывают дифференциальное выражение путей, связанных с регуляцией митохондрий и сигнализацией оксида азота. Заключения: Возраст донора значительно изменяет васкулогенную функцию hiPSC-EP. Эти результаты подчеркивают необходимость учета возрастных факторов донора в сосудистой инженерии на основе hiPSC и подчеркивают потенциальные преграды для перевода терапий, основанных на hiPSC, в популяцию пожилых пациентов.
Мощные антиопухолевые препараты, такие как афатиниб и доксорубицин в свободной форме, связаны с системной токсичностью. Для решения этой проблемы мы разработали носитель, который высвобождает лекарства, включая афатиниб и доксорубицин, специально в области низкоинтенсивного ультразвука. Этот удаленно активируемый и фокусированный подход позволяет высвобождать лекарства непосредственно в точке фокуса ультразвука, тем самым уменьшая нежелательные внеклассные эффекты и в концентрациях, определяемых длительностью применяемого ультразвука. Мы произвели чувствительные к ультразвуку микрокапсулы с высокой эффективностью инкапсуляции (39,6% для афатиниба и 46,6% для доксорубицина). Микрокапсулы состоят из чувствительной к ультразвуку системы доставки лекарств, основанной на диблочном кополимере метоксиполи(этиленгликоль)-поли(D,L-молочной кислоты) (mPEG-PDLLA) и перфлуороктилбромиде (PFOB). Антиопухолевые агенты были инкапсулированы в этих микрокапсулах посредством совместного испарения во время синтеза частиц. Микрокапсулы высвобождали доксорубицин и афатиниб зависимо от давления ультразвука, с рассчитанными половинно максимальными давлениями высвобождения (P50) 0,61 МПа и 0,72 МПа соответственно. Таким образом, эффективная инкапсуляция гидрофобных антиопухолевых агентов и высвобождение, вызванное ультразвуком в зависимости от дозы, представляет собой новый метод целевой доставки лекарств и основу для будущих целевых химиотерапий.
Целью настоящего исследования было оценить эффективность обучения на основе симуляции в улучшении возможностей реагирования на неотложные ситуации во время эндоскопической практики. В обучении участвовали врачи, медсестры, лабораторные технологи и клинические инженеры, работающие в отделении эндоскопии. Программа обучения на основе симуляции использовала смоделированные сценарии и проводилась под руководством сертифицированной медсестры по неотложной помощи. Перед началом обучения, сразу после него и через месяц после завершения занятия были проведены тесты на знание. Результаты тестов сравнивались по временным промежуткам и между профессиональными группами. В исследовании приняли участие двадцать два человека (14 врачей, семь медсестер и один лабораторный технолог). Процент правильных ответов улучшился по всем пунктам сразу после обучения по сравнению с результатами до обучения: правильные сжатия груди (< 0,01), препараты для остановки сердца (< 0,01), препараты для лечения анафилаксии (= 0,13), показания к дефибрилляции (< 0,01), местоположение автоматического внешнего дефибриллятора (AED) (= 0,01) и номер телефона службы экстренной помощи (Code Blue) (< 0,01). Однако через месяц после тренировки большинство показателей вернулись к уровням до обучения, за исключением показаний к дефибрилляции и номера телефона службы экстренной помощи. В анализе подгрупп по профессиям, когда сравнивались процент правильных ответов сразу до и сразу после обучения, врачи продемонстрировали значительные улучшения в местоположении AED (= 0,03) и номере телефона Code Blue (< 0,01), тогда как медсестры показали значительное улучшение в использовании препаратов для остановки сердца (= 0,02). Обучение на основе симуляции эффективно для повышения знаний об оказании неотложной помощи в гастроэнтероскопии. Однако может потребоваться повторное или непрерывное обучение для поддержания этих результатов.
Для оценки больших языковых моделей (БЯМ) в предэндоскопической (ПЭ) стратификации риска и предсказании эндоскопических находок при кровотечении из верхних отделов желудочно-кишечного тракта (КВУГЖ), а также для сравнения их эффективности с клиническими шкалами риска, традиционными моделями машинного обучения (МО) и гибридными подходами. Это многоцентровое ретроспективное исследование включало 384 пациента с КВУГЖ, которые прошли эндоскопию. Пять БЯМ были протестированы с использованием структурированных нулевых запросов на основе клинических и лабораторных данных ПЭ. Их эффективность в выявлении пациентов с высоким риском была сопоставлена с шкалой Глазго-Блэтчфорда (GBS), AIMS65, шкалой Рокалла для ПЭ и моделями МО. Также были оценены гибридные модели БЯМ-шкала. Два гастроэнтеролога оценили качество обоснований, сгенерированных БЯМ. GBS показала наилучшие дискриминационные показатели среди клинических шкал (площадь под кривой операционной характеристикой [AUROC] 0.73). Среди БЯМ GPT-5 достиг наивысшей точности (0.66), в то время как Grok продемонстрировала наилучшие сбалансированные показатели (0.59; F1 0.47). Gemini-2.5-Flash имела наивысшую чувствительность (0.89), но низкую специфичность (0.21). Эндоскопические предсказания имели скромную производительность, при этом Gemini-2.5-Flash достигла наивысшей точности точного соответствия (0.34) и микро-F1 (0.38). Гибридные модели улучшили результаты по сравнению с отдельными БЯМ, но не превзошли GBS (лучший: GBS+GPT-5, AUROC 0.67). БЯМ показали более высокие численные показатели по сравнению с традиционными моделями МО, но статистическое сравнение было невозможно из-за отсутствия данных на уровне экземпляров. Grok получила наивысший балл человеческой оценки за качество объяснений. БЯМ показали умеренное качество в стратификации риска КВУГЖ и предсказании эндоскопии, но уступили клиническим шкалам, особенно GBS. Гибридные модели немного улучшили показатели по сравнению с отдельными БЯМ, но не превзошли GBS, поддерживая их использование как вспомогательных инструментов, а не систем поддержки клинического решения.